10 多个数据集间细胞类型鉴定[celltype Identification]

对每个数据集/组进行差异基因表达检测,并使用元分析方法组合p值,探索每个聚类保守的标记基因,并使用它们来注释我们的细胞类型。

Perform differential gene expression detection on each data set / group, use meta-analysis methods to combine p-values, explore marker genes that are conserved in each cluster, and use them to annotate our cell types.

保守标记基因及分布[marker gene]

保守标记基因分布

Figure 10.1: 保守标记基因分布

PDF 文件 : all-feature.jpg

保守标记基因表达模式[expression of marker]
保守标记基因表达

Figure 10.2: 保守标记基因表达

PDF 文件 : all-DotPlot.jpg

鉴定细胞类型tSNE[cell type]

tSNE

Figure 10.3: tSNE

PDF 文件 : all-DimPlot.jpg