根据大家的需求和建议,极客基因生物信息学服务平台每隔三个月会进行一次调整和更新,更新时间为3月、6月、9月、12月。
极客基因感谢您的使用,欢迎您的建议。如果您的建议被我们采用,可增加平台使用期限。
Bulk RNA-seq平台:数据准备、差异分析、PCA分析、相关性分析、火山图、散点图、单基因表达水平、热图.
Bulk RNA-seq平台:增加GO分析、Pathway分析
10X Genomics平台:单样本(指控与过滤、选择高差异基因、PCA线性降维、细胞分群、标记基因、鉴定细胞群);多样本联合分析(样本前期处理、样本间保守的标记基因、重新定义细>胞群、差异基因、基因表达谱可视化);多样本时序性分析(样本前期处理、挑选聚类基因、聚类、挑选时序性分析基因、时序性分析、拟时序差异基因分析).
Bulk RNA-seq平台:增加PCA三维分析、最小生成树分析、tSNE分析、K-Means分析、差异基因条形图、韦恩图;图片提供了更多的修改方式,可更改色彩、大小、字体大小等
10X Genomics平台:增加细胞群中基因表达列表.
单细胞转录组平台:数据准备、差异分析、聚类分析(PCA二维分析、PCA三维分析、相关性分析、最小生成树分析、tSNE分析、K-Means分析)、差异基因描述(火山图、散点图、差异基因条形图)单基因表达水平、热图、韦恩图、GO分析、Pathway分析。
10X Genomics平台:添加细胞群鉴定(通过已有数据库)、细胞亚群间的相关性分析、细胞周期分析、对样本添加自定义标签,将多样本分析拆分成更多功能.
1、极客基因生物信息学服务平台:修改整个分析平台页面布局。
2、数据下载系统使用云服务,不在此页面登录.
3、上线自助服务系统,用户可自行上传数据进行分析,数据上传格式需严格按照说明进行.
1、Bulk RNA-seq平台:更换了差异表达分析和GO分析使用的R包,分析更准确、速度更快;调整了交互界面布局,操作更加便捷;美化了部分页面。
2、Smart-seq2单细胞转录组平台:增加了线粒体百分比显示和UMAP分析功能。