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10X Genomics
10X Genomics数据的分析平台,提供:
● 单样本分析:质控与过滤、选择高差异基因、PCA线性降维、细胞分群、标记基因、鉴定细胞群
● 多样本联合分析:样本前期处理、样本间保守的标记基因、重定义细胞群、差异基因、基因表达谱可视化
● 多样本时序性分析:样本前期处理、挑选聚类基因、聚类、挑选时序性分析基因、时序性分析、拟时序差异基因分析
Smart-seq2
Smart-seq2数据分析平台,提供:
● 数据准备、差异分析、单基因表达水平、热图、韦恩图、GO分析、Pathway分析
● 聚类分析(PCA二维分析、PCA三维分析、相关性分析、最小生成树分析、tSNE分析、K-Means分析)
● 差异基因描述(火山图、散点图、差异基因条形图)